大宝元年（701）は藤原不比等にとって、とても重要な年となりました。ひとつは、不比等も制定に大きく関わった大宝律令が施行され、日本の律令国家としての歩みが始まったこと。もうひとつは、娘の宮子（みやこ）と文武（もんむ）天皇との間に、首皇子が生まれたことです。またこの年、不比等自身も県犬養三千代（あがたのいぬかいのみちよ）との間に光明子（こうみょうし）をもうけています。当時不比等は44歳。その人生でもっとも充実した年だったといえます。
　不比等が正史に初めて登場するのは、持統天皇3年（689）のこと。『日本書紀』には、不比等がこの年、現在の裁判官に相当する判事の一人に任官されたことが記されています。その後697年には文武天皇が即位。不比等はこの文武天皇から格別の信頼を得ていたらしく、即位後まもなく娘の宮子を入内させ、また文武天皇2年（698）には、中臣鎌足が晩年天智天皇から賜った藤原の姓を、不比等とその子孫のみのものとする詔も出ています。しかし慶雲4年（707）、文武天皇は25歳の若さで崩御。その遺児で不比等の孫である首皇子は当時まだ7歳。この時から、首皇子を皇位につけることが、不比等や文武天皇に近い皇族の、共通の目的となりました。
　首皇子の成長を待つ間、別の皇子が即位しては、その子供が皇太子となってしまいます。そこで考え出されたのが、文武天皇の母親である女帝・元明（げんめい）天皇の即位です。首皇子の即位という目的を天皇と共有する不比等は、以後絶大な権力を振るうこととなりました。平城京遷都は、この元明天皇の時代に行われたことです。
　元明天皇は和銅8年（715）、娘で首皇子の伯母の元正（げんしょう）天皇に譲位します。首皇子は当時15歳。すでに元服し皇太子となっていましたが、この元正天皇の即位にも、不比等らの深い深謀遠慮があったと考えられます。高齢の元明天皇が直接首皇子に譲位すると、元明天皇に万一のことがあった場合、首皇子の後ろ盾が無くなってしまいます。そこで、まだ若い元正天皇を間に入れ、首皇子即位後の地位をより万全にしようとしたのでしょう。元正天皇は当時36歳。この年まで未婚でいたことを考えると、このことは元明天皇即位時から予定されていたのかもしれません。
　霊亀2年（716）、首皇子は不比等の娘・光明子と結婚し、２年後には阿倍（あべ）内親王（後の孝謙・称徳天皇）が生まれています。首皇子が即位し聖武天皇となったのは神亀元年（724）のこと。しかし不比等はその4年前に亡くなっており、念願だった首皇子の即位を見届けることはできませんでした。その後、不比等の子の武智麻呂（むちまろ）、房前（ふささき）、宇合（うまかい）、麻呂（まろ）は最大の政敵であった長屋王（ながやおう）を長屋王の変で自害に追い込み、光明子は皇族以外では初の皇后となります。以後藤原氏の繁栄は、1000年以上にわたり続くこととなるのです。

※記載している年齢は数え年です。また生没年には諸説あります